体温や心拍数、睡眠といった生体リズムが体内時計によって１日のなかで変動することをいいます。

うつ病になると、程度の差はありますが日内変動がほとんどの方が見られます。体内時計がずれてしまう特徴があるため、朝が最も具合が悪く、夕方になるにつれて改善していくような気分の波が出てきます。他に、睡眠リズムが崩れてしまい、不眠や過眠といった睡眠障害を併発することがあります。